Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxO54751 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxO54751 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrxO54751 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrxO54751 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrxO54751 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrxO54751 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms