Protein–RNA interactions for Protein: O35929

Rem1, GTP-binding protein REM 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rem1O35929 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rem1O35929 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rem1O35929 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rem1O35929 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rem1O35929 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rem1O35929 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms