Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emp3O35912 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emp3O35912 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms