Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifnar2O35664 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifnar2O35664 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms