Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clk4O35493 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk4O35493 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk4O35493 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms