Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edil3O35474 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms