Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcc1O35379 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.52■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcc1O35379 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms