Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KeraO35367 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KeraO35367 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KeraO35367 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KeraO35367 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KeraO35367 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KeraO35367 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms