Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn1O35350 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn1O35350 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Capn1O35350 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Capn1O35350 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capn1O35350 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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