Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms