Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarb2O35114 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarb2O35114 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scarb2O35114 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scarb2O35114 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarb2O35114 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Scarb2O35114 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarb2O35114 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scarb2O35114 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Scarb2O35114 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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