Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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