Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClockO08785 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClockO08785 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClockO08785 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClockO08785 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ClockO08785 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClockO08785 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClockO08785 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClockO08785 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms