Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms