Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mfsd4b4J3QNS5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms