Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17577J3QNF7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17577J3QNF7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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