Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20918J3QN17 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20918J3QN17 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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