Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
E030018B13RikJ3QMS9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms