Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
7530416G11RikJ3QJX6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms