Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21060J3KMU4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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