Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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