Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pabpc4lG5E8X2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms