Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arfip1G5E8V9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfip1G5E8V9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms