Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HrcG5E8J6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HrcG5E8J6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms