Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vmn1r67G5E8C1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r67G5E8C1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms