Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcf11G3X9Z4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms