Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rnf148G3X9R7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf148G3X9R7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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