Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna9G3X8Z7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms