Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ercc6F8VPZ5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc6F8VPZ5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms