Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms