Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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