Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17093F6XGJ4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17093F6XGJ4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms