Protein–RNA interactions for Protein: F6VUT6

Gm8251, Predicted gene 8251, mousemouse

Predictions only

Length 1,994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8251F6VUT6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8251F6VUT6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8251F6VUT6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms