Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5861F6VCN9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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