Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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