Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm340F6RGI3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms