Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Erich3F6QRE9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Erich3F6QRE9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms