Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf165E9QAU8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms