Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmod3E9QA62 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmod3E9QA62 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms