Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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