Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Urb2E9Q7L1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Urb2E9Q7L1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Urb2E9Q7L1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Urb2E9Q7L1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Urb2E9Q7L1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Urb2E9Q7L1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Urb2E9Q7L1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Urb2E9Q7L1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Urb2E9Q7L1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms