Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Simc1E9Q6E9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms