Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pgbd1E9Q492 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pgbd1E9Q492 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pgbd1E9Q492 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pgbd1E9Q492 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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