Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Susd1E9Q3H4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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