Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp1E9Q368 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms