Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms