Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Hectd4E9Q2E4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms