Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zfp558E9Q1J0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp558E9Q1J0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp558E9Q1J0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp558E9Q1J0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp558E9Q1J0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp558E9Q1J0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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