Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms