Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc1E9Q043 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms